水稻植株彗星实验步骤通过将Singh和Gichner等人建立的碱性彗星实验方案应用于水稻（OryzasativaL.）来确定原发性DNA损伤。所有的实验步骤都是在冰床上避光进行的。1、对于每一盆水稻，取鲜叶0.1g，用刀片切碎，加入2个100μL装有三羟甲基氨基甲烷盐酸提取缓冲液（Tris-HCl提取液，0.1M，pH=7.5，4℃保存）的离心管中；2、每个离心管中取75μL含细胞核样本添加到150μL低熔点琼脂糖凝胶（LMPA，1%）中，混合；3、取75μL上述混合物，沉积在用正常熔点琼脂糖凝胶（NMPA，1%）制备的载玻片上，然后盖上盖玻片；4、重复步骤3，每个样品制备3张载玻片，4℃保存15min；5、在载玻片上添加一层LMPA以保护含有核的凝胶层；6、将载玻片置于含有强碱性缓冲液（0.3MNAOH和1MEDTA，pH＞13）的电泳槽中浸泡15min，诱导DNA的展开和变性；7、电泳，电压为25V，电流为30mA，持续5min，将DNA片段从未受损的DNA链中分离出来，温度4℃，避光；8、观察载玻片，每张载玻片分析30个核，利用连接到图像分析系统的摄像机对彗星进行了检测，并利用图像软件分析；9、彗星尾部端点强度（TI）与DNA损伤水平呈线性关系。
